三只松鼠招股說明書披露，三只松鼠2014年度、2015年度的毛利率分別為24.15%和26.90%。根據三只松鼠的統計，來伊份、鹽津鋪子、好想你等可比實體店2014、2015年的平均毛利率為43.06%和43.69%。雖然2016年三只松鼠毛利率為30.20%，呈現穩定增長之勢，但與實體店同行相比依然有不少差距。
三只松鼠解釋稱，“2014-2015年是公司的快速發展期，需通過價格策略擴大市場份額，因而公司毛利率低于可比公司。“所謂“價格策略”，說明三只松鼠并未脫離零食電商品牌通過大打“價格戰”，求得大幅業績增長的套路。
與此同時，零食電商品牌必須承擔高昂的平臺推廣費、平臺傭金以及物流快遞等費用。以百草味為例，據公開資料顯示，上述三項費用曾經在百草味2013年、2014年以及2015年前三季度的銷售成本中分別占到61.4%、69.8%、68.8%的比重。食品電商品牌幾乎淪為電商平臺的打工仔。
值得注意的是，電商平臺催生“爆款”的特性一方面使得多數零食品牌聚焦于堅果等熱門品類，缺乏強勢的新品研發能力，使得同質化競爭嚴重。相比之下，線下連鎖零食專業店則更注重新品開發，例如某連鎖零食專業店看到休閑健身活動營收同比增長15.4%，因而開發具備充饑、能量補充等特性的運動飲品，市場表現良好。
為此，不少電商品牌試圖弱化對天貓商城、京東、1號店等線上銷售平臺的依賴度。通過開發自營APP，團購、線下實體店等新渠道，成為能夠存活的“獨立品牌”。如此一來，線下實體零食專業店不僅要與同業態經營者競爭， 還要面對涉足線下的電商品牌，以及不少傳統零售商新近開出的自有零食“店中店”，競爭激烈可見一斑。
“從目前來看，首先是連鎖零食品牌去整合數量眾多的個體零食品類經營者，當市場逐漸被幾大巨頭切割完成，就是品牌與品牌間的互相吞并。即使市場份額巨大，為提升對零食產業前、后端的掌控力，老大都想去吃掉老二，老二也試圖上位，所謂的“諸侯割據”注定不會長久?！蹦成鲜辛闶尺B鎖品牌商品總監分析稱。